目標(biāo)區(qū)域捕獲測序技術(shù)，是根據(jù)已知特定基因組區(qū)域序列設(shè)計(jì)寡核苷酸探針，通過雜交將目標(biāo)區(qū)域捕獲富集進(jìn)行二代測序。其針對目標(biāo)區(qū)域深度測序，增加了檢查靈敏度和準(zhǔn)確性。既滿足研究需求，又降低測序成本，在科研、臨床中均備受關(guān)注。
液體處理專家貝克曼庫爾特推出Biomek 自動(dòng)化捕獲測序方案，幫助您實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化、標(biāo)準(zhǔn)化的捕獲測序。 由自動(dòng)化工作站進(jìn)行基因捕獲，可以減少手工操作時(shí)間，提高工作效率，增加結(jié)果的重復(fù)性和均一性。 Biomek工作站可實(shí)現(xiàn)從核酸提取，文庫構(gòu)建，定量混樣到捕獲的整體實(shí)驗(yàn)流程。
Figure 1. 捕獲測序文庫構(gòu)建自動(dòng)化流程
由Biomek成功自動(dòng)化的雜交捕獲試劑盒：
Agilent HaloPlex™ Target Enrichment - Ion Torrent
Agilent SureSelect XT®
Epicentre ScriptSeq® Complete Gold Low Input
Illumina Nextera® Rapid Capture
Illumina TruSeq® Exome
Illumina TruSeq® Rapid Exome
Illumina TruSight® Cancer
Illumina TruSight® Tumor 15
Illumina TruSight® Tumor 170
IDT xGen® Exome Research Panel
NEB NEBNext Direct™ Cancer HotSpot Panel
Roche Nimblegen SeqCap EZ® for Illumina NGS
Biomek自動(dòng)化捕獲測序數(shù)據(jù)展示
Figure 2. IDT xGen® Exome Research Panel試劑盒捕獲測序文庫制備。
上圖： 片段分析，其中主峰1和2為雜交捕獲后cfDNA目標(biāo)片段峰；
下圖：Qubit Fluorometric Quantification核酸定量結(jié)果。
Figure 3. IDT xGen®雜交捕獲試劑盒歷史手工數(shù)據(jù)vs.
Biomek i7自動(dòng)化工作站完成數(shù)據(jù)。A. 平均中靶率，B. 重復(fù)率，C. 覆蓋度，D. GC偏移。
Biomek向?qū)杰浖僮鹘缑?/strong>
在軟件操作界面上用戶可以選擇樣本數(shù)量，是否使用臺面整合的PCR儀，以及運(yùn)行工作流程的哪個(gè)部分。此外，具備臺面自動(dòng)校對功能，當(dāng)操作人員完成耗材擺放后，工作站可根據(jù)攝像頭拍攝，自動(dòng)判定耗材擺放是否正確，對錯(cuò)誤擺放位置進(jìn)行提示。避免由于人為擺放耗材錯(cuò)誤，導(dǎo)致設(shè)備碰撞或試劑、時(shí)間損失。
Figure 4. 向?qū)杰浖僮?，IDT xGen® 雜交捕獲試劑盒方法選擇界面。
Biomek自動(dòng)化捕獲測序——實(shí)踐速度與通量的飛躍
Figure 5. 完成 24/48/96個(gè)樣本的自動(dòng)化IDT xGen®雜交捕獲測序文庫制備預(yù)估耗時(shí)。
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