使用時應該選擇從下往上逐級增大顆粒直徑的原則，不能選擇直接用過細的石英砂直接鋪設，否者會造成運行時候的噪聲過大，在原水泵的強大壓力下會造成細小的石英砂快速的上浮彼此互相撞擊一起涌向過濾罐的上端。
填裝時亦不是把罐體填的越滿越好，通常填裝到罐體容量的三分之二處即可，過滿的話會導致出水堵塞和不易反洗，并且在初次運行時候必須把濾料進行正、反洗沖洗干凈后再投入正常使用。
在選擇多介質濾料時候，由于過濾器的的底層鋪設較大的鵝卵石，通常直徑在16-32mm或者8-16mm的為佳，可有效的防止在運行或者反洗時候石英砂的上揚和彼此互相撞擊導致破碎過快，造成堵塞下級過濾器致使損耗過快；中層選擇4-8mm的石英砂，上層則以選擇鋪設2-4mm的顆粒為佳。
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